Diversos mecanismos pueden causar el prolapso de la válvula mitral. En la mayoría de los casos es inofensivo y no ocasiona síntomas ni requiere tratamiento, pero en un pequeño número de casos, puede causar regurgitación mitral severa (filtración de sangre de regreso a través de la válvula) y es necesario tratarlo con cirugía.

Algunos tipos de prolapso de la válvula mitral parecen ser hereditarios. Se ha asociado esta condición con el síndrome de Marfan (un trastorno congénito), la enfermedad de Graves y otros trastornos.

Muchos de los individuos con prolapso de la válvula mitral son mujeres delgadas que pueden presentar deformidades menores de la pared torácica, escoliosis u otros trastornos. También se puede presentar un defecto septal auricular (un orificio en la pared que separa las cámaras superiores del corazón izquierda y derecha) en la parte alta de la pared del corazón (denominado ostium secundum).