El tratamiento puede dividirse en dos fases iniciales que son decisivas. La cirugía temprana es apropiada para casi todos los pacientes y se deben hacer todos los esfuerzos para practicarla dentro de las primeras 24 horas de ocurrida la perforación.

La primera fase incluye: estudios diagnósticos que se hacen para determinar la localización y la causa del orificio, administración de líquidos y antibióticos IV para prevenir o tratar la infección. Por otra parte, el líquido que se ha acumulado alrededor de los pulmones se puede drenear con un tubo a tórax.

El tratamiento definitivo es la reparación de la perforación. En algunos pacientes con perforación de la parte más alta del esófago se puede dar la cicatrización espontánea de la lesión, si el paciente se abstiene de ingerir líquidos por un período de tiempo, caso en el cual es necesario administrar la nutrición por otra vía, como por ejemplo un tubo de alimentación colocado en el estómago.

Si la perforación se encuentra en las partes media o inferior del esófago, por lo general se requiere reparar el defecto por medio de una operación. Dependiendo del tamaño y de la localización de la perforación, la fístula puede tratarse por reparación primaria o con la extracción del esófago.

El pronóstico es bueno en el caso de pacientes en los que se hace un diagnóstico temprano (menos de 24 horas). La tasa de supervivencia es del 90% cuando la cirugía se lleva a cabo dentro de las primeras 24 horas, sin embargo esta tasa baja a aproximadamente el 50% cuando se demora el tratamiento.

Dentro de las complicaciones se incluyen:

• Lesión permanente del esófago (p.ej. estrechamiento)
• Formación de un absceso alrededor del esófago
• Infección en y alrededor de los pulmones

Se debe solicitar asistencia médica inmediata si la persona está en el hospital, de lo contrario se debe acudir al servicio de emergencia o llamar al número local de emergencia (como el 911 en los Estados Unidos) si la persona se ha sometido recientemente a una cirugía o a la colocación de un tubo en el esófago y presenta dolor, dificultad para deglutir o respirar o tiene otra razón para sospechar que pueda estar sufriendo una perforación esofágica. El tiempo es esencial en el tratamiento de esta condición.