Algunas infecciones se resuelven solas y se pueden utilizar agentes antinfecciosos como el metronidazol o la quinacrina. La furazolidona se usa generalmente para tratar a los niños. Los porcentajes de curación pueden ser superiores al 80%. La resistencia a la droga puede ser un factor que no permita el éxito del tratamiento, lo cual hace a veces necesario un cambio en la terapia de antibióticos.

En el embarazo, se debe posponer el tratamiento hasta después del parto, puesto que ninguna de las drogas para tratar la infección ha sido aprobada para uso durante el período de la gestación.

La resolución espontánea es común, sin embargo, se han reportado infecciones persistentes que requieren tratamiento con antibióticos. Algunas personas que padecen infecciones por Giardia durante mucho tiempo muestran una resolución de los síntomas muy lenta aun después de que ha desaparecido la infección.

• Deshidratación
• Malabsorción (absorción inadecuada de los nutrientes desde el tracto intestinal)
• Pérdida de peso

Se debe buscar asistencia médica si la diarrea u otros síntomas persisten después de la fase aguda (hasta 14 días), o si se presenta sangre en las heces o deshidratación.