El embarazo tiende a ser la primera razón a considerar ante la ausencia de un período, pero existen muchas causas para el retraso de la menstruación. El aumento del riesgo está asociado con ejercicios extremos y prolongados (en especial sin acondicionamiento adecuado), contenido de grasa corporal menor al 15 ó17%, obesidad extrema e ingestión de suplementos hormonales. La ansiedad por un posible embarazo puede causar retrasos, incrementando aún más la ansiedad. El sufrimiento emocional por otras causas también puede retrasar el período. La drogas con busulfán, clorambucil, ciclofosfamidas, anticonceptivos orales, fenotiazinas y los anticonceptivos no orales (como Norplant y Depo-Provera) pueden producir períodos intermitentes o irregulares. Ciertos procedimientos como la dilatación y curetaje (D y C) también pueden hacer que una mujer desarrolle amenorrea si se presenta tejido cicatricial dentro de la cavidad uterina. La aparición temprana de la menopausia puede ser la causa de muchos de los casos (la menopausia es normal en las mujeres mayores de 45 años). La incidencia de una amenorrea secundaria (debida a causas distintas al embarazo) es de un 4% en la población general.
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