La causa del absceso epidural es una infección localizada entre los huesos del cráneo o la columna vertebral y las meninges externas, que son las membranas que recubren el cerebro y la médula. Si la infección se encuentra en el área del cráneo, se clasifica como un absceso epidural intracraneal, y si se encuentra en el área de la médula, se clasifica como un absceso epidural de la médula. La infección generalmente es bacteriana, el estafilococo es común, pero en algunos casos puede ser también micótica. El material infectado (pus) generalmente incluye las células tisulares destruidas, glóbulos blancos y microorganismos vivos y muertos que pueden separarse en un absceso. La inflamación del tejido que circunda el absceso se presenta como respuesta a la infección. La mayoría de los síntomas se deben al crecimiento del absceso y a la inflamación del área que lo circunda, lo cual causa que los tejidos del cerebro y la médula se compriman. La infección puede producirse por la expansión de las infecciones localizadas cerca del absceso o por microorganismos localizados en áreas distantes del mismo y que viajan por medio de la circulación sanguínea. No obstante, la causa de la infección no se identifica en más de una tercera parte de los pacientes. Los factores de riesgo de los abscesos epidurales intracraneales (dentro del craneo) incluyen: infección crónica del oído, mastoiditis,sinusitis crónica, además de lesiones en la cabeza y neurocirugía reciente. Los pacientes con infecciones óseas de la columna vertebral como la osteomielitis vertebral, infecciones de la piel como forúnculos, infecciones de la sangre, cirugía de espalda u otros procedimientos invasivos que involucran la espina dorsal, pueden presentar abscesos epidurales. También las personas que se inyectan drogas están en alto riesgo de desarrollarlos. El absceso epidural es una enfermedad rara, nueve casos de diez se localizan en la médula. Esta infección puede diseminarse a los huesos de la columna o del cráneo ocasionando osteomielitis, así como al líquido cefaloraquídeo ocasionando meningitis, o conllevando a la formación de un absceso cerebral o un absceso de la médula espinal.
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