Es una conexión creada entre dos estructuras, órganos o espacios. Comúnmente se refiere a la conexión creada mediante cirugía entre dos estructuras tubulares como el corte trasversal de los vasos sanguíneos o las asas del intestino. Por ejemplo una anastomosis intestinal se realiza cuando un segmento intestinal se reseca y los dos extremos restantes se cosen o se unen (se anastomosan).

Ejemplos de anastomosis quirúrgicas son la colostomía (una abertura que se crea entre el intestino y la piel abdominal) y la fístula arteriovenosa (una abertura creada entre una arteria y una vena) para realizar la hemodiálisis.

Una anastomosis patológica puede ser producto de un trauma o una enfermedad y puede comprometer venas, arterias o intestinos, a las cuales se les llama fístulas. Las venas, las arterias o las fístulas traumáticas por lo genral se presentan entre una arteria y una vena y las fístulas traumáticas e intestinales por lo general se presentan entre dos asas del intestino (fístula entero-entérica) o intestino y piel (fístula enterocutánea).