Se le pide al paciente que se acueste en una mesa estrecha (camilla) que se desliza hacia el centro del escáner. Dependiendo del estudio que se vaya a realizar, al paciente se le puede pedir acostarse boca arriba, de espaldas o de lado. Si se va a administrar un medio de contraste, al paciente se le coloca una línea intravenosa en una pequeña vena de la mano o del brazo. De manera muy similar a como funcionan las cámaras fotográficas estándar, los movimientos del paciente hacen que se produzcan imágenes borrosas en la TC. Por lo tanto, el técnico que opera el escáner y que supervisa al paciente le da instrucciones a través de un intercomunicador para que contenga la respiración y no se mueva. A medida que se realiza el examen, la camilla avanza a pequeños intervalos a través del escáner. Los escáner modernos en "espiral" pueden realizar el examen en un movimiento continuo de la camilla. Generalmente, los rastreos completos tardan sólo unos pocos minutos; sin embargo, al tiempo de rastreo se le agregan los rastreos adicionales de mejoramiento de contraste o de alta resolución. Los modernos escáner multi-detector pueden tomar imágenes de todo el cuerpo, de los pies a la cabeza, en menos de 30 segundos.
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