Primero se debe obtener el líquido del saco que rodea el corazón. En algunas personas se puede poner un monitor cardíaco antes de la prueba para controlar las alteraciones cardíacas. También en el tórax se ponen unos parches llamados electrodos de manera similar a un ECG. Es posible que se realice una radiografía torácica o un ultrasonido antes del examen. Se lava la piel del tórax con jabón antibacterial. Con frecuencia un cardiólogo o un médico preparado obtiene la muestra. Se inserta una pequeña aguja dentro del tórax por entre las costillas dentro del pericardio, saco delgado que rodea el corazón, y se extrae una pequeña cantidad de líquido. Se presenta una sensación de presión y algo de dolor a medida que la aguja es insertada en el tórax. También después del procedimiento puede haber un ECG y una radiografía torácica. Algunas veces se obtiene el líquido pericárdico durante una cirugía a corazón abierto. Se aplica una gota del líquido pericárdico en una capa muy delgada del portaobjetos del microscopio, a esto se le denomina frotis. Luego el espécimen se colorea con una serie de tinciones conocida como tinción de Gram. Primero se usa una tinción violeta cristal, luego yodo, luego se decolora y después se colorea con safranina. Posteriormente el frotis coloreado se observa bajo el microscopio para detectar la presencia de bacterias.
El color, el número y la apariencia morfológica (forma) de las células posibilitan la identificación del organismo infeccioso.
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