Adultos y niños: Hay muchas maneras de recolectar las muestras. Se pueden recoger las heces con la ayuda de un envoltorio plástico que se coloca suelto sobre el inodoro y se sostiene en su lugar con el asiento. Luego se coloca la muestra en un recipiente limpio. El equipo para recolección de la muestra trae una gasa especial que se usa para recogerla. Después se coloca la muestra en un recipiente limpio. Bebés y niños pequeños: Para los niños que usan pañales, se puede cubrir el pañal con un envoltorio plástico. Si se coloca correctamente el envoltorio plástico separando las heces de la orina, se evita que éstas se mezclen, lo que asegura una muestra mejor. Una pequeña cantidad de la muestra de heces se coloca en el portaobjetos del microscopio y se examina para detectar la presencia de organismos anormales. Se puede aplicar un colorante para resaltar ciertos organismos bajo el microscopio.
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