Se le pide al paciente que se acueste sobre una camilla angosta que luego se desliza hasta el centro del escáner. Dependiendo del estudio que se vaya a realizar, puede ser necesario que el paciente se acueste boca abajo, boca arriba o de lado y, en caso de que se vaya a administrar un medio de contraste, se debe colocar un acceso intravenoso en una pequeña vena de la mano o del brazo. Muy similar a como sucede con las cámaras fotográficas comunes, el movimiento del sujeto hace que se produzcan imágenes borrosas en la TC; por lo tanto, el técnico que opera el escáner y supervisa al paciente debe darle instrucciones a través del intercomunicador sobre cuándo debe contener la respiración y permanecer inmóvil. A medida que se realiza el examen, se avanza con el caballete en pequeños intervalos a través del escáner. Con la versión moderna en "espiral" de estos aparatos, se puede llevar a cabo la examinación en un movimiento continuo del caballete. Normalmente, el procedimiento completo toma sólo unos cuantos minutos, sin embargo, la TC de resalte del contraste o de alta resolución harán que el procedimento tome más tiempo. Los escáneres multidetectores más nuevos pueden tomar imágenes de todo el cuerpo, de la cabeza a los pies, en menos de 30 segundos.
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