Los principales riesgos de la broncoscopia son:

• Infección
• Sangrado en el sitio de la biopsia

También existe un pequeño riesgo de:

• Ritmo cardíaco irregular (arritmia)
• Ataque cardíaco
• Nivel bajo de oxígeno en la sangre (hipoxemia)
  • el riesgo de hipoxemia puede ser mayor si se realiza un lavado bronco-alveolar
• Neumotórax

En los casos poco frecuentes en los cuales se utiliza anestesia general, se presenta algún riesgo de:

• Náuseas
• Vómitos
• Dolor de garganta
• Dolor muscular
• Dificultad respiratoria
• Disminución de la frecuencia cardíaca
• Cambios en la presión sanguínea

Existe un bajo riesgo de:

• Ataque cardíaco
• Lesión renal

Cuando se realiza una biopsia, puede presentarse el riesgo de hemorragia y es común que haya un poco de sangrado, pero el técnico o la enfermera se encargarán de monitorearlo.

Existe un riesgo significativo de ahogamiento si se ingiere cualquier alimento, incluso agua, antes de que desaparezca el efecto de la anestesia.

El reflejo nauseoso debe reaparecer antes de comer o beber algo luego de realizar la broncoscopia. Para comprobarlo se debe colocar una cuchara en la parte posterior de la lengua durante unos pocos segundos con una ligera presión; si no se presenta náusea, se debe esperar 15 minutos e intentar de nuevo. Se recomienda no utilizar objetos pequeños ni punzantes para realizar esta prueba.