Las muestras de una biopsia del intestino delgado pueden obtenerse por EGD (esofagogastroduodenoscopia) u otra endoscopia del tracto gastrointestinal superior. Se introduce un tubo flexible de fibra óptica (endoscopio) a través de la boca o la nariz hasta el tracto gastrointestinal superior. Las muestras de tejido obtenidas durante la endoscopia se envian al laboratorio para examinarlas. Con la biopsia por cápsula se obtiene una muestra representativa del recubrimiento intestinal (mucosa) y permite examinar áreas que están fuera del alcance del endoscopio. El procedimiento es similar al de la EGD. La parte posterior de la garganta se impregna con anestesia local para prevenir las náuseas, se introducen el tubo y la cápsula a través de la boca y se le solicita a la persona deglutir a medida que el tubo avanza. Para favorecer el paso de la cápsula hacia el estómago e intestino delgado es probable que el paciente, en vez de estar sentado, se coloque sobre el costado derecho. Luego de que la cápsula se encuentre ubicada adecuadamente, se le aplica succión al tubo (lo que hace que la cápsula se cierre tomando el tejido). Finalmente, se retiran el tubo y la cápsula una vez que se obtiene la muestra del tejido.
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