Debido a que esta enfermedad no es causada por bacterias, los antibióticos no ayudan a tratar la infección causada por este virus. La atención médica hospitalaria estándar puede ayudar a disminuir el riesgo de complicaciones en caso de enfermedad severa. Actualmente no se dispone de una vacuna humana y es probable que tome algunos años desarrollar una.

Los estudios de investigación clínicos están encaminados a determinar si la ribavirina, un medicamento antiviral utilizado para tratar la hepatitis C, puede ser de utilidad.

En general, el resultado probable de una infección leve causada por el virus del Nilo Occidental es excelente; mientras que el pronóstico es más reservado para los pacientes con la forma severa de la enfermedad. La encefalitis o la meningitis del oeste del Nilo tiene el potencial de ocasionar lesiones cerebrales y la muerte y aproximadamente el 10% de los pacientes con inflamación cerebral no sobrevive.

Las complicaciones a causa de la infección leve por el virus del Nilo occidental son extremadamente raras; mientras que las complicaciones a causa de la forma severa de la infección incluyen daño cerebral o debilidad muscular permanentes (algunas veces similares a la polio) y la muerte.

Se debe buscar asistencia médica si la persona presenta cualquiera de los síntomas de la infección por el virus del Nilo occidental, particularmente si se ha estado expuesto a los mosquitos. En caso de presentar enfermedad severa, se recomienda buscar atención médica en una sala de emergencias.

No existe tratamiento para evitar el desarrollo de la infección por el virus del Nilo occidental cuando se sufre la picadura de un mosquito infectado. Las personas con buen estado general de salud no suelen enfermarse de gravedad, incluso si las pica un mosquito infectado.